genetic code id:see gencode.dmp file inherited GC flag (1 or 0): if node inherits genetic code from parent mitochondrial genetic code id: -- see gencode.dmp file inherited MGC flag (1 or 0): -- 1 if node inherits mitochondrial gencode GenBank hidden flag (1 or 0) : -- 1 if n...
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Genetic Code:Standard Location:genomic ③下载.tbl文件 2)该页面的下半部分有一个“continue”按钮,需要拖动鼠标往下找,点击此按钮进行下一步。 08 Review and Correct 最后一步啦,就是查看检验你填的信息有没有问题,有问题的话还可以修改,确认无误之后,最后点击“Finish submission”提交,最后结果等邮件通知行了。
·核苷酸序列(Nucleotid Sequences)包括GenBank和Sequence Read Archive(SRA)两个数据库; ·基因组变异(Genome Variations)包括单核苷酸多样性(SNP),变异数据库(dbVar),临床变异数据库(ClinVar),遗传检测注册表(Genetic Testing Resgistry(GTR)); ·实验研究和数据集(Experimental Studies & DataSets)包括基因表达综合...
tblastx:只在特殊情况下使用,它将DNA被检索的序列和核酸序列数据库中的序列按不同的阅读框全部翻译成蛋白质序列,然后进行蛋白质序列比对。操作界面与blastn和blastp很相似,差别在于在Choose File下有Genetic Code的选项来选择翻译的密码子模板。 Blastx的余下部分就是Blastp的蛋白质数据库;tblastn则为Blastn的核酸数...
在这里我们需要录入更多与该序列有关的信息,最主要的就是录入之前已经整理好的序列里面的开放阅读框(ORF)信息:Genetic Code设置为”Standard“,5'和3'都勾选上,Protein Name/Protein Description项都填写,将特定区域(ORF)的核苷酸序列翻译为氨基酸序列后(除去末端的终止子)复制到下方的”Amino Acid Sequence“框中,...
cerevisiae] strain [strain=S288C] isolate [isolate=CWS1] # 代表在什么个体上获得的样品 chromosome [chromosome=XVI] topology [topology=circular] location [location=mitochondrion] molecule [moltype=mRNA] (DNA is the default) technique [tech=wgs] protein name [protein=helicase] genetic code [gcode...
在这里我们需要录入更多与该序列有关的信息,最主要的就是录入之前已经整理好的序列里面的开放阅读框(ORF)信息:Genetic Code设置为”Standard“,5'和3'都勾选上,Protein Name/Protein Description项都填写,将特定区域(ORF)的核苷酸序列翻译为氨基酸序列后(除去末端的终止子)复制到下方的”Amino Acid Sequence“框中,...
在这里我们需要录入更多与该序列有关的信息,最主要的就是录入之前已经整理好的序列里面的开放阅读框(ORF)信息:Genetic Code设置为”Standard“,5'和3'都勾选上,Protein Name/Protein Description项都填写,将特定区域(ORF)的核苷酸序列翻译为氨基酸序列后(除去末端的终止子)复制到下方的”Amino ...
starts -- start codons for this genetic code delnodes.dmp --- Deleted nodes (nodes that existed but were deleted) file field: tax_id -- deleted node id merged.dmp --- Merged nodes file fields: old_tax_id -- id of nodes which has been merged new_tax_id -- id of ...